Anläßlich der 30. Wiederkehr der Bischofsernennung von Johann Weber, Diözesanbischof von Graz-Seckau, wurde für den Ehrensenator und Ehrendoktor der Karl-Franzens-Universität Graz am 11. Juni 1999 eine Festakademie veranstaltet. In diesem feierlichen Rahmen wurde ihm die Medaille „Pro Meritis“ in Gold der Uni Graz verliehen.